近日,一家致力于复生灭绝物种的美国公司colossal宣称,已灭绝的袋狼基因组几乎完成测序,完成度超99.9%,仅剩下45个空缺有待填补,但该公司并未提供任何证据支持这一声明。
袋狼,又名塔斯马尼亚虎,是一种曾广泛分布于澳大利亚的肉食性有袋动物,但当欧洲探险家抵达时,它们的栖息范围已缩小至塔斯马尼亚岛。最后一只已知的袋狼于1936年在动物园死亡。
2017年,研究人员首次对一只保存于酒精中108年的袋狼进行了基因组测序。然而,该基因组远未完整,存在许多空缺。
“获取几乎任何生物的完整基因组都相当的困难。”丹麦哥本哈根大学的emilio mármol-sánchez说,她的团队是首个从保存的袋狼样本中提取rna的团队。例如,人类基因组的最后几个部分直到近几年才完成测序。
现在,colossal公司表示,其借助从一颗保存120年的牙齿中提取的额外dna,基本完成了袋狼的基因组。
“我们的基因组并不像人类基因组那样完整,但我们能够利用一些相同的技术。”colossal科学顾问委员会成员、澳大利亚墨尔本大学表观遗传学教授andrew pask说。pask指出,完全测序植物和动物的基因组很困难,因为其中许多区域的序列包含大量重复。标准的测序技术一次只能处理小段dna,而对于这些重复区域并不适用。
较新的长读技术可以测序更大的dna片段。然而,古老的dna通常会断裂成许多小片段,因此这些方法不常奏效。
“大多数古老样本保存的dna片段长度大约在十几个碱基,幸运的话可能有几百个。我们获得的样本保存得非常完好,以至于我们能够恢复长达几千个碱基的dna片段。”pask说。
由于缺乏其他袋狼基因组进行比较,目前没有直接判断基因组完整性的方法。pask表示,colossal正在使用同一家族中的其他相关物种进行这一估算。
即使该基因组像colossal所认为的那样完整,并且确实能够填补剩余空缺,但是目前没有生成包含该基因组活细胞的可行方法。因此,colossal计划对一种现存名为“脂尾袋鼬”的有袋动物进行基因改造,使其更像袋狼。
“这更像是对某些特征的再现。”mármol-sánchez说,“它将不是一种灭绝的动物,而是对现代动物的一种相当奇特的改造版本,类似于我们对那些灭绝动物的想象。”
colossal称,它对培养的袋鼬细胞基因组进行了创纪录的300次基因编辑。目前所有的改变都是小范围的,但pask表示,团队计划在不久的将来更换成千上万对的袋狼dna碱基对。目前尚不清楚需要进行多少次编辑才能实现公司复生袋狼的目标。
当被问及colossal为什么没有提供任何支持其声明的证据时,该公司首席执行官ben lamm表示,公司唯一关注的是复生灭绝物种,而不是撰写科学论文。
“我们不是一个以发表论文为主要目标的学术实验室。”lamm说,“我们将继续取得比撰写科学论文过程更快的进展。”
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